本发明涉及一种细胞系中食管癌功能基因敲除后增殖表型的快速鉴定方法，属于分子生物学技术领域。本发明中的细胞系中食管癌功能基因敲除后增殖表型的快速鉴定方法，利用流式细胞分选仪，将200个带有载体荧光标签的阳性细胞群分选到96孔板的两个孔中，培养0h后进行片段分析（Fragment analysis，FA），可检测到CRISPR‑Cas9打靶该功能基因后目的基因座发生有效编辑的克隆；培养7天后，再次进行片段分析，此时片段分析峰图可根据不同细胞的增殖特性发生变化，其中增殖速度快的细胞出峰显著，而增殖速度慢的细胞群则出峰不明显，甚至不出峰；由此可快速判断食管癌功能基因敲除后的增殖表型。

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